In ziekenhuizen en klinische zorg wordt medicinale lucht voornamelijk gebruikt voor beademings- en aerosoltherapie, en gedurende anesthesie:
Bij de behandeling van respiratoire aandoeningen zoals astma en COPD, is rechtstreekse inhalatie in de longen een effectieve manier om medicatie toe te dienen. Voor de toediening van geïnhaleerde medicatie aan patiënten die geen inhalators kunnen gebruiken worden vernevelaars gebruikt. Medicinale lucht kan worden gebruikt om omgevingslucht naar de vernevelaar te drijven, waar vloeibare medicatie wordt omgezet in een nevel die direct in de longen kan worden geïnhaleerd.
Medicinale lucht wordt gebruikt als draaggas voor narcotische substanties in geïnhaleerde anesthesie. Het kan ook worden gebruikt met lachgas als substituut voor zuurstof om de blootstelling aan de hoge zuurstofconcentratie te verminderen.
Sommige patiënten zijn afhankelijk van een betrouwbare en kwalitatief hoogstaande toevoer medicinale lucht ter bescherming van hun delicate en gevoelige luchtwegen.